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2024
1.
서문수빈; 유선용
Abstract | Links | BibTeX | Tags: CYP450, Deep learning, Graph attention network
@conference{서문수빈2024cytochrome,
title = {Cytochrome P450 동위체 억제제 예측을 위한 그래프 어텐션 네트워크 모델 개발},
author = {서문수빈 and 유선용},
url = {https://www.dbpia.co.kr/pdf/pdfView.do?nodeId=NODE11861993&googleIPSandBox=false&mark=0&minRead=5&ipRange=false&b2cLoginYN=false&icstClss=010000&isPDFSizeAllowed=true&accessgl=Y&language=ko_KR&hasTopBanner=true},
year = {2024},
date = {2024-01-01},
urldate = {2024-01-01},
booktitle = {한국정보과학회 학술발표논문집},
journal = {한국정보과학회 학술발표논문집},
pages = {804–806},
publisher = {한국정보과학회},
abstract = {Cytochrome P450 효소는 모든 대사 반응 중 약 75%를 책임지며, 특히 1A2, 2C9, 2C19, 2D6, 3A4 등은 대다수 약물의 대사에 관여하고, 다수의 부작용을 유발하는 것으로 알려져 있다. 이에 따라, 신약 개발 과정에서 이들 cytochrome P450을 억제하는 화합물을 식별하는 것은 매우 중요하다. 본 논문은 약물 분자의 그래프 구조를 이용하고 self-attention 메커니즘을 적용하여 P450 동위체를 억제하는 화합물을 예측하는 새로운 모델을 제안한다. 이 모델은 Graph Attention Network (GAT)를 활용하여 분자의 그래프 표현을 학습하고, Fully-connected layer을 통해 예측을 수행한다. 또한, 데이터의 불균형 문제를 해결하기 위해 Focal loss 함수를 적용하였다. 이 연구는 in vivo에 드는 비용과 시간을 절감하고, 신약 개발의 기간과 비용을 줄이는데 기여할 것으로 기대된다},
keywords = {CYP450, Deep learning, Graph attention network},
pubstate = {published},
tppubtype = {conference}
}
Cytochrome P450 효소는 모든 대사 반응 중 약 75%를 책임지며, 특히 1A2, 2C9, 2C19, 2D6, 3A4 등은 대다수 약물의 대사에 관여하고, 다수의 부작용을 유발하는 것으로 알려져 있다. 이에 따라, 신약 개발 과정에서 이들 cytochrome P450을 억제하는 화합물을 식별하는 것은 매우 중요하다. 본 논문은 약물 분자의 그래프 구조를 이용하고 self-attention 메커니즘을 적용하여 P450 동위체를 억제하는 화합물을 예측하는 새로운 모델을 제안한다. 이 모델은 Graph Attention Network (GAT)를 활용하여 분자의 그래프 표현을 학습하고, Fully-connected layer을 통해 예측을 수행한다. 또한, 데이터의 불균형 문제를 해결하기 위해 Focal loss 함수를 적용하였다. 이 연구는 in vivo에 드는 비용과 시간을 절감하고, 신약 개발의 기간과 비용을 줄이는데 기여할 것으로 기대된다